香菇菌丝生长的适宜条件是温度为22℃～26℃，空气湿度为60％～65％，通风良好，黑暗或弱光。
接种后1～6天，是菌丝萌生和定植期，由于菌丝生长微弱，菌袋温度比室温低1℃—3℃，为给菌丝提供适宜温度，要将室温调为28℃～29℃，每天要测定室温、堆平和袋温，其中以袋温为主调理室平和堆温。此时不宜移动菌袋，以防杂菌感染。3天内不通风或大批通风。 接种后7～10天，菌丝向料内蔓延，袋温逐渐降低，将室温控制为25℃～27℃。过7天末尾翻堆，以后每7～10天翻堆1次。在翻堆时，逐袋反省菌丝生长状况及杂菌感染状况。发现漏接种的菌袋或没有发菌的接种穴，应将其集中到其他中央，挖除霉点，并用5％～10％的石灰水涂抹患处，培育室每天通风1～2次，每次约30分钟。
接种后11～20天，菌丝进入旺盛生临时，各种代谢活动加快，袋温高出室温1℃～5℃，要特别留意降平和通风。将室温控制为20℃～24℃，每天通风1～2小时。
接种后20天，因菌丝少量生长，袋内氧气不能满足菌丝生长要求，缺氧成为菌丝生长的限制要素，应及时揭去接种穴上的胶布，或用刺孔的方法添加氧气。第一次刺孔的时间在菌丝圈直径为8～10厘米时停止。用消过毒的牙签在菌丝圈前沿刺6～10个孔，孔深不能触及料层。当接种穴之间的菌丝相连时，用消过毒的毛衣针停止第二次刺孔增氧。当菌丝发满袋时，用消过毒的筷子在菌袋周身刺孔，刺孔的数目及深度，视温度及菌丝生长状况而定。温度高时多刺孔、深刺孔，反之少刺孔、浅刺孔。揭胶布或刺孔后，菌丝减速生长，菌袋温度会猝然降低。此时要加大通风量，并疏散菌袋，防止烧堆。经30～50天，菌丝长满菌袋，可停止菌筒转色和生理成熟管理。
菌筒转色是香菇菌丝发育的一个特殊生理进程，也是菌丝发育成熟的标志。菌筒转色适宜的条件：温度18℃～24℃，菌筒周围小气候的空气湿度为 80％～85％，有一定散射光及
良好的通风条件。当菌丝长满袋后，应将遮阳物去掉，以添加室内光照。室温严厉控制在20℃～24℃，温差不要太大，少移动菌袋。若用大袋栽培，菌筒转色和生理成熟时间为25～30天；若用小袋栽培，转色时间为10～15天。在此进程中，菌丝逐渐倒伏并分泌褐色素，使菌筒由白色变为棕白色。转色条件适宜，菌筒转色平均，菌膜厚薄分歧，出菇划一，则产量高，质量好。若转色太浅或不平均，则出菇质量差，畸形菇多。若转色太重，菌膜过厚，则出菇慢，产量低。