早春气温较低，细菌的活动频率虽然有所减弱，但稍遇合适的条件即可大量繁殖，危害鸡群健康。加之早春气候寒冷，鸡体的抵抗力普遍减弱，若忽视消毒工作，极易导致疫病暴发和流行。一般在冬春季节常用饮水消毒的办法进行消毒，即在饮水中按比例加入消毒剂（如百毒杀、强力消毒灵、次氯酸钠、威岛消毒剂等），每周进行一次即可。而对鸡舍内的地面则可使用白石灰、强力消毒灵等干粉状的消毒剂进行喷洒消毒，每周1～2次较为适宜。
另外，早春季节的天气仍然寒冷，除了保温取暖还要通风透气。若只强调鸡舍保温而往往忽视通风透气，会极易导致舍内空气污浊、病菌大量滋生。鸡长时间吸入二氧化碳、氨气等有害气体及生长在病菌滋生的环境，如大肠杆菌病、慢性呼吸道病、传染性支气管炎、喉炎、二氧化碳中毒症往往高发，导致成活率下降。正确的方法应该每隔2～3小时通风10～15分钟。特别是塑料薄膜保温的育雏阶段，最好在棚顶部开数个天窗，达到既保暖又排浊气的目的。当人进入鸡舍无不良异味感，棚内四周塑料膜上无水珠粘挂为理想的环境。同时，要及时清除鸡舍的粪便和垫料，使舍内由鸡粪中挥发出来的氨降低到最低水平。